| 1 | Nghiên cứu phân lập và tuyển chọn nấm rễ Arbuscular Mycorrhizae để xử lý cho cây trồng | Nguyễn Thị Minh, Võ Thị Ngọc Bích | Trường | Chủ trì | 2004 |
| 2 | Ảnh hưởng của một số loại phân bón hữu cơ đến sự thiết lập mối quan hệ cộng sinh của Vesicular arbuscular mycorrhizae và cây chủ | Nguyễn Thị Minh, Nguyễn Thị Hương Lan | Trường | Chủ trì | 2005 |
| 3 | Hiệu quả của việc xử lý Arbuscular Mycorhizae đến sự sinh trưởng và phát triển của cây họ đậu trên đất phù sa sông Hồng | Nguyễn Thị Minh, | Trường | Chủ trì | 2006 |
| 4 | Nghiên cứu sản xuất chế phẩm dinh dưỡng vi sinh đa chức năng từ phế thải chăn nuôi dạng lỏng và vi sinh vật nội sinh | Nguyễn Thị Minh, Vũ Thị Xuân Hương, Nguyễn Tất Cảnh | Trường trọng điểm | Chủ trì | 2015-2017 |
| 5 | "Nghiên cứu khả năng ức chế tuyến trùng, thành phần môi trường, điều kiện nuôi cấy đến sự phát triển của nấm vòng" thuộc đề tài “Ứng dụng công nghệ nano sản xuất chế phẩm sinh học dạng dịch thể từ vi sinh vật và thảo mộc phòng trừ tuyến trùng và bệnh rễ cây hồ tiêu ở Tây Nguyên | Nguyễn Thị Minh, Vũ Thị Xuân Hương, Nguyễn Thị Khánh Huyền, Nguyễn Thuỳ Linh | Nhánh cấp nhà nước | Chủ trì | 2017 |
| 6 | Phát triển công nghệ sản xuất vật liệu sinh học của Nhật Bản để tái tạo thảm thực vật che phủ tạo cảnh quan và bảo vệ đất dốc ở Việt Nam | Nguyễn Thị Minh, Nguyễn Thu Hà, Phạm Châu Thuỳ, Lê Minh Nguyêtj, Nguyễn Thị Khánh Huyền | Đề tài cấp Nhà nước | Chủ trì | 2017-2019 |
| 7 | Đánh giá hiện trạng môi trường và ứng dụng CNSH trong xử lý mùi và chất thải rắn tại các trang trại chăn nuôi gà trên địa bàn tỉnh Hưng Yên | Nguyễn Thị Minh, Phạm Châu Thuỳ, Nguyễn Thu Hà, Hồ Thị Thuý Hằng | Cấp tỉnh | Chủ trì | 2018-2019 |
| 8 | Thí điểm công nghệ sản xuất phân hữu cơ khoáng chuyên dùng cho cây trồng chủ lực từ chất thải chăn nuôi và phụ phẩm phụ phẩm khí sinh học ở Việt Nam | Nguyễn Thị Minh, Nguyễn Thanh Hải, Nguỹen Văn Dung, Hồ Ngọc Ninh, | Cấp Bộ | Tư vấn trưởng | 2018-2019 |
| 9 | Đánh giá hiệu quả của chế phẩm vi sinh vật Bukhoderia vietnamesis TVV75 bón cho lúa ở đồng bằng sông Hồng | Nguyễn Xuân Thành, Nguyễn Thị Minh, Lê Thị Hồng Xuân | hợp tác | Tham gia | 1998 |
| 10 | Nghiên cứu sản xuất phân bón vi sinh dùng để bón cho cây đậu đỗ | Nguyễn Xuân Thành, Nguyễn Thị Minh, Lê Thị Hồng Xuân | Cấp Bộ | Tham gia | 1999 |
| 11 | Xây dựng quy trình sản xuất chế phẩm hỗn hợp vi sinh vật (VKCĐN2 + VKPGL) và đánh giá hiệu lực của loại chế phẩm này trên cây đậu tương | Nguyễn Xuân Thành, Nguyễn Thị Minh, Lê Thị Hồng Xuân | Nhánh cấp NN KHCN 02-06-2000 | Tham gia | 2000 |
| 12 | Sản xuất phân bón vi sinh vật từ phế thải nông nghiệp và rác thải sinh hoạt cho rau sạch | Đào Châu Thu, Đỗ Nguyên Hải,Nguyễn Xuân Thành, Nguyễn Thị Minh, Lê Thị Hồng Xuân | Nghị định thư với Ý | Tham gia | 2003-3004 |
| 13 | Xây dựng quy trình sản xuất chế phẩm vi sinh vật để xử lý phế phụ phẩm đồng ruộng thành phân hữu cơ tại chỗ bón cho cây trồng | Nguyễn Xuân Thành, Nguyễn Thị Minh, Lê Thị Hồng Xuân | Cấp Bộ B2004-32-66 | Tham gia | 2004-2005 |
| 14 | Nghiên cứu biện pháp sinh học xử lý ô nhiễm Cu, Zn, Pb trong đất nông nghiệp | Nguyễn Hữu Thành, Nguyễn Thị Minh, Trần Thị Lệ Hà, ... | Cấp Bộ trọng điểm | Tham gia | 2006-2007 |
| 15 | Nghiên cứu vật liệu sinh học nhằm tái tạo thảm thực vật phủ xanh đất trống đồi núi trọc | Nguyễn Thu Hà, Nguyễn Thị Minh, Phan Quốc Hưng, Vũ Thị Xuân Hương, Nguyễn Tú Điệp | Trường trọng điểm | Tham gia | 2012-2013 |
| 16 | Nghiên cứu ứng dụng quy trình kỹ thuật của trường Đại học Nông nghiệp để xử lý chất thải cho các trang trại chăn nuôi lợn tại huyện Hoằng Hóa, tỉnh Thanh Hóa | Nguyễn Tất Cảnh, Lê Vũ Quân, Nguyễn Thị Minh, Nguyễn Văn Ngà, | Cấp tỉnh | Tham gia | 2012-2013 |